El 4 de mayo de 1961, Independiente debutó en la Copa Libertadores de América. Fue en la cancha de Racing, en una derrota por 2 a 0 a manos del Palmeiras de Brasil, con goles de Gildo y Zequinho.
Con los años, el "Rojo" se convertiría en el equipo más ganador de este trofeo.